观心

by Fan Yang

我认为，今后生物研究的一个方向或者目标就是：更快、更准确地认识蛋白质的功能。这也是蛋白质组学发展的趋势。怎么样向这个目标努力呢？

首先，为了更准确地研究某种蛋白质的功能，必须认识它的三维结构。结构决定功能。然而，目前的状况是，对已知结构的蛋白质，我们从结构推测功能，用结构来解释功能的能力还是有限的。所以，应用分子动力学模拟的方法，计算、模拟蛋白质在特定环境中的行为是很有希望的。

其次，如何更快地认识蛋白质的三维结构呢？应用X射线衍射或者NMR，能得到比较精确的结构，但是，它们耗时太长，使得现在已知三维结构的蛋白质的数量极为有限，和已知的蛋白质氨基酸序列数量相比简直是沧海一黍。如果能结合目前大量的已知蛋白质序列和有限的精确三维结构，将有可能推测出一大批蛋白质的结构，尽管可能不是很精确。令人高兴的是，目前出现的homology modeling，threading等方法，正是向着这个方向的努力。

所以，现在，或是不远的将来，我们将能够构建一个这样的研究体系，它以计算机为基础工具，能够进行蛋白质三维结构的快速获取、获取的结构的验证、基于结构的蛋白质行为模拟、模拟结果的分析与检验。这样的一个系统，必须以大型计算机，或者是数十至上百个CPU组成的并行计算机群为支撑，才能在较短的时间内获得有意义的、完整的研究结果，获得相对于传统分子生物学实验室手段的优势。

我努力着、期待着这一天的到来。

在一个盲人组成的国家里，一个拥有明亮眼睛的人就可以当皇帝。
——古德里安


这两天读古德里安写的回忆录，20、30年代他一手建立德国装甲部队的历程读起来真是让人唏嘘不已。在一支10万人的小型陆军里，面对着一群资历高得多、但观念陈旧的上级，坚持自己的理论多么不易！没有真正的装甲车、坦克，就用帆布蒙在架子上的模型来演习，艰难的路啊：“终于有一天，孩子们的铅笔再也戳不破我们的战车的外壳、甚至步兵们的刺刀也对它无可奈何.....” 苦涩而豪迈！

装甲、火力、机动，只准集中、不准分散，装甲师、无线电、身先士卒的指挥，面对着如此先进、如此朝气蓬勃的德军，老迈僵化英法联军怎堪一击！