PubMed使用介绍
Sunday, 29. April 2007, 15:51:35
文章来源: 丁香园 文章编辑: bluelove
关键词: PubMed 方法 图片 NCBI
丁香园上关于PubMed的使用介绍应该是不少了。我只是想用图形的方式演示给大家看看,另外再加了点以往介绍不多的部分。比如PubMed的Cubby(一个很好的跟踪文献的工具),还有Pubmed的Single Citation Matcher(如果你想找你手中文章的参考文献,用这个再好不过了)。PubMed的文章已经有15 million了,但能给出全文及全文链接的并不多。PubMed Central能提供大概300000篇免费全文,对这部分我做了简单的介绍。
下面让我们进入PubMed的页面,相信大家已经很熟悉了。最上面一行为查询框,接下来的为特征栏,我会再做介绍。在首页的文字部分给出了三种查询方式:
1、主题检索。很简单,在查询框输入主题词(如:hypertension),点右边的“go”就OK了;
2、著者检索。奇怪的是用的是合乎中国人的习惯,即姓+名字的首字母。如果老外的名字是Francis S. Collins。那你就应该输入
Collins FS;
3、期刊检索。可以用期刊的全称或缩写。

下面这副图是我在查询栏里输入hypertension之后点击"go"之后的结果了。PubMed默认的显示格式是summary,每篇文章的显示包括以下几个
部分作者姓名、文章标题、年月卷期和起始终止页码、PMID号。你可以更改显示方式、每页显示文章的数目、及文章的分类显示方式。记住改完后单击“Display按钮”。

下面这一页是我输入作者姓名collins fs之后的结果。

这一页是我输入期刊名nature genetics的结果,你可以看到nature genetics的缩写是Nat Genet。

下面让我们来看看特征栏部分了。我先介绍“Limit部分”。Limit可以限制检索字段、印刷物类型、年龄、性别、子集、出版年月等等。我就不一个一个讲了,你可以自己点开来看看。值的注意的是,使用“Limit”会排除还未标引好的文献。如果你要查找最新文献,建议不要使用Limit。

下面是我给出的一个例子,我要检索的是collins fs的综述,语言限制为英语(有点画蛇添足了)出版日期限制为1990.01.01到2004.08.10。再限制为Human。

结果数由上面的318减少到31了,文章类型也标识为review了。Limit条件会在上面列出。并在“Limit”前出现一小勾。值得注意的是,你在下一次检索时记得将小勾去掉,因为限制条件会自动保留。

下面我再介绍介绍文章的标记。下图用框框标记的四种标记,分别有各自的意思。图中已给出说明了,我就不重复劳动了。单击相应的标记可以看文章的更详细的说明。在文章标题的右边给出相关文章的链接及外部链接。你可以自己点开看看。

下面我们再来看看特征栏的Preview/Index部分。点击特征栏的“Preview/Index”可以进入该页。你可以在查询框输入你的检索词,点击“Preview”查看文章的数目。下面不同的颜色说明操作的步骤。我会在下一页给出实例。你先按我的提示输入hypertension,再点“Preview”。

下面图中给出预览的结果,共找到了235897篇文章。这么多文章怎么看啊。我们来试试加点限制吧。按我的提示输入,先1再2再3就行了。我加的条件是限制作者为gu d。

好了,只剩下32篇文章了。我再来介绍Preview/Index的后半部分吧。按我的提示操作吧。

按上图点击Index后出现下图,再按提示操作吧。

看看你操作之后的结果吧。只剩下两篇文章了。哈哈,会了吧。没骗你吧。用这个就可以不用去记那些烦人的[AU]、[journal]了。

再来看看Clipboard吧。-干吗用的?-用处大了!你可以把你找到的满意的文章存入Clipboard,然后再一起去看啊。按提示操作吧,不会骗你的。

好了,我们来看看吧。单击特征栏的Clipboard进入下页,看看你选的文章在里面了。还会以绿色表示呢。怎么样有点成就感了吧。

别告诉我你上面的都会了哦。会就会吧,总有人不会。下面我要介绍的部分估计你就不一定会了。下面介绍的是Cubby和Single Citation Match。这是两个不错的工具。你可以用Cubby跟踪文献,用Single Citation Match找到你要的单篇文章(当然也可以找多篇了)。

先介绍Cubby吧,要想用Cubby必须先申请,就象你用邮箱要先申请一样。申请我就不讲了,比申请邮箱简单。登录也一样了。

下面显示我登录后的结果了。图中标记的意思我都做了说明。如果你登录后再去PubMed检索文献的话,你再单击Cubby就会显示你刚刚用过的检索策略。你就可以保存了。我总共保存了8条记录,这可是我的个人隐私哦。

下面你就能了解Cubby的用处了,按我的提示操作吧。哈哈,是不是觉着老按提示不爽啊。没意见,你可以自己乱点啊。

现在明白Cubby的用处了吧,前一幅图里显示我是2004年4月9号检索过ffq(食物频率问卷),看看现在又有24篇新文献了。我点24 New,就能看到了。省得再去找了。怎么样?用这个跟踪文献还行吧。

下面我再来介绍一下Single Citation Match,也很好用哦。有一种检索方法叫循环检索,就是说你按你手中的文献提供的参考文献的信息再去找文献。用Single Citation Match就很方便了,你只要把参考文献中提供的信息填进去,点Search就OK了。

文章出现了,就一篇。知道为什么叫Single Citation Match了吧。当然,如果你只输入nature reviews genetics那就是多篇了。不过也有用吗,你可以拿来查期刊了。

再提一下Pubmed Central吧,点击首页上下面的图标就进去了。里面可全是免费的全文呐!

点进去之后就是下面这个样子了,记住PMC。在PubMed的下拉菜单里也有哦。好了,我讲了这一大堆就不再罗索了,虽然有的还没提到,那些没提到的可不是没有用啊。你们自己看看Tutorial吧。

(全文完)








清隐子 # 1. May 2007, 09:54
鬼羽箭 # 1. May 2007, 14:39
国内的有清华同方、重庆维普等,不过都是收费的。
(羽)